تحلیل ابردرخت ها (Supertrees) در خانواده مگس گیریان (Aves, Muscicapidae)
Authors
Abstract:
آرایه شناسان به منظور حل ابهامات آرایه شناختی در سطح فراگونه ای از روش ترسیم ابردرخت ها استفاده نموده تا با ادغام کردن درخت ها در مقیاسی بزرگ به بازسازی روابط تبارزادی بپردازند. در این مطالعه به منظور ادغام تمامی درخت های مولکولی موجود و ارائه روابط کامل تبارشناختی بین افراد خانواده مگس گیریان بر روی یک درخت واحد تبارشناختی، تمامی داده های موجود برای ژن های مختلف میتوکندریایی و هسته ای در بانک ژن و نمونه های تعیین توالی شده در آزمایشگاه مولکولی دانشگاه فردوسی مشهد استفاده گردید. در این مطالعه ترسیم ابردرخت براساس ماتریس پارسیمونی (MRP) و با استفاده از 15 درخت منبع برای 166 گونه پرنده از اعضای خانواده مگس گیریان صورت پذیرفت. در ابردرخت ترسیم شده، دو کلاد اصلی دیده می شود که در مجموع حدود 82% از گره های این ابردرخت دارای وضعیت حل شده هستند. باید توجه داشت که بیش از 80 درصد گره ها در این ابردرخت دارای وضعیت حل شده هستند و نحوه قرارگیری کلادهای اصلی مطابق با درخت های مولکولی مطالعات قبلی اعضای این خانواده در ژن های مختلف است. ابردرخت نهایی، نتیجه ای قطعی برای فرضیات روابط بین اعضای خانواده مگس گیریان نیست، ولی قادر است روابط بین گروه ها را بر اساس مطالعات قبلی مولکولی تائید کند. در واقع این روش در کنار مطالعات آرایه شناختی مقایسه ای با استفاده از داده های اولیه حاصل از آنالیزهای مولکولی و ریخت شناسی می تواند منتهی به ارائه مستدل و جامع ترین روابط آرایه شناختی گردد.
similar resources
Niltavinae, a new taxon of Old World flycatchers (Aves: Muscicapidae).
The relationships among Old World chats and flycatchers (Muscicapidae) have recently been clarified in two independent molecular phylogenetic studies (Sangster et al. 2010, Zuccon & Ericson 2010). Both studies recovered a well-supported clade of predominantly blue flycatchers of the genera Niltava, Cyornis, Eumyias and Cyanoptila, some species traditionally included in the genus Rhinomyias and ...
full textSaxicola syenitica Heuglin, 1869 (Aves: Passeriformes: Muscicapidae), an overlooked taxon of Oenanthe?
The North African population of the Black Wheatear has been treated as Oenanthe leucura syenitica for over 100 years. The type of syenitica was collected by Heuglin in June 1852 near the southern Egypt/northern Sudan border, well outside the range of the sedentary Black Wheatear. Morphometric inference and genetic analyses of partial sequences of the mitochondrial gene COI demonstrate that the ...
full textConvergent evolution of morphological and ecological traits in the open-habitat chat complex (Aves, Muscicapidae: Saxicolinae).
Open-habitat chats (genera Myrmecocichla, Cercomela, Oenanthe and relative) are a morphologically and ecologically cohesive group of genera with unclear phylogenetic relationships. They are distributed mostly in open, arid and/or rocky habitats of Africa and Eurasia. Here, we present the most comprehensive molecular phylogenetic analysis of this group to date, with a complete taxon sampling at ...
full textCorrecting the "correct" name for the Asian Brown Flycatcher (Aves: Passeriformes, Muscicapidae, Muscicapa).
EDWARD C. DICKINSON1, RICHARD SCHODDE2, SVEN KULLANDER3, PIERRE ANDRÉ CROCHET4, ANDY ELLIOTT5& GUY M. KIRWAN6 1Flat 3, Bolsover Court, 19 Bolsover Road, Eastbourne, BN20 7JG, U.K. E-mail: [email protected] 2Australian Biological Resources Study, G.P.O. Box 787, Canberra City, ACT, Australia 2601. E-mail: [email protected] 3Department of Zoology, Swedish Museum of Natural History, P. O....
full textRecent divergence between two morphologically differentiated subspecies of bluethroat (Aves: Muscicapidae: Luscinia svecica) inferred from mitochondrial DNA sequence variation.
We assessed the mitochondrial DNA sequence divergence of a 718 bp fragment of the control region and 1007 bp of the cytochrome b gene between two allopatric morphologically different subspecies of bluethroat (Luscinia svecica). None of the 17 total haplotypes was shared between L. s. namnetum and L. s. svecica. However, the mean distances between subspecies were very low for both fragments (0.0...
full textMajority-rule supertrees.
Most supertree methods proposed to date are essentially ad hoc, rather than designed with particular properties in mind. Although the supertree problem remains difficult, one promising avenue is to develop from better understood consensus methods to the more general supertree setting. Here, we generalize the widely used majority-rule consensus method to the supertree setting. The majority-rule ...
full textMy Resources
Journal title
volume 30 issue 1
pages 159- 176
publication date 2017-08-23
By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.
Keywords
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023